Pasar al contenido principal

Microbiología

El grupo de investigación de Microbiología del Instituto de Investigación Vall d'Hebron (VHIR) se centra en el estudio de los aspectos microbiológicos —en investigaciones básicas, traslacionales y clínicas— que podrían mejorar los resultados de los pacientes con enfermedades infecciosas.

Nuestras áreas de investigación prioritaria son:

  • Vigilancia microbiológica de enfermedades infecciosas emergentes y re-emergentes
    • Enfermedades por infecciones virales de las vías respiratorias
    • Microorganismos que producen enfermedades prevenibles por vacunación
    • Enfermedades infecciosas de transmisión sexual
  • Resistencia antimicrobiana
  • Sepsis
  • Desarrollo y validación de dispositivos de diagnóstico microbiológico rápido
  • Salud Internacional
  • Hepatitis 

Colaboramos activamente con otros laboratorios de microbiología, servicios sanitarios, centros y organizaciones nacionales e internacionales, así como con las distintas redes de investigación del Instituto de Salud Carlos III en España.

Además, llevamos a cabo una importante actividad en la vigilancia de la evolución genotípica y fenotípica de los microorganismos presentes en la comunidad en cuanto a su virulencia, transmisibilidad, escape antigénico y resistencia antimicrobiana, en colaboración con las administraciones públicas, tanto en el ámbito nacional como internacional.
 

 

Equipo

Yesilkoy Filiz

Yesilkoy Filiz

Investigador sénior
Microbiología
Leer más
Yesilkoy Filiz

Yesilkoy Filiz

Investigador sénior
Microbiología
Leer más

Publicaciones

In-Host HEV Quasispecies Evolution Shows the Limits of Mutagenic Antiviral Treatments.

PMID: 38139013
Revista: INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES
Año: 2023
Referencia: Int J Mol Sci. 2023 Dec 6;24(24):17185. doi: 10.3390/ijms242417185.
Factor de impacto:
Tipo de publicación: Artículo en revista internacional
Autores: Adombi, Caroline Melanie; Buti, Maria; Campos, Carolina; Colomer-Castell, Sergi; Cortese, Maria Francesca; Esteban, Juan Ignacio; Garcia-Cehic, Damir; Gregori, Josep; Ibanez-Lligona, Marta; Quer, Josep et al.
DOI: 10.3390/ijms242417185

Epidemiological and Genetic Characterization of Norovirus Outbreaks That Occurred in Catalonia, Spain, 2017-2019.

PMID: 35336893
Revista: Viruses-Basel
Año: 2022
Referencia: Viruses. 2022 Feb 27;14(3). pii: v14030488. doi: 10.3390/v14030488.
Factor de impacto: 5.048
Tipo de publicación: Artículo en revista internacional
Autores: Razquin, Efren, Cornejo Sanchez, Thais, Bartolome, Rosa, Torner, Nuria, Izquierdo, Conchita, Soldevila, Nuria, Coronas, Lorena, Dominguez, Angela, Fuentes, Cristina, Pinto, Rosa M et al.
DOI: 10.3390/v14030488

Inspecting the Ribozyme Region of Hepatitis Delta Virus Genotype 1: Conservation and Variability.

PMID: 35215809
Revista: Viruses-Basel
Año: 2022
Referencia: Viruses. 2022 Jan 22;14(2). pii: v14020215. doi: 10.3390/v14020215.
Factor de impacto: 5.048
Tipo de publicación: Artículo en revista internacional
Autores: Rodriguez-Frias, Francisco, Pacin-Ruiz, Beatriz, Cortese, Maria Francesca, Tabernero, David, Sopena, Sara, Gregori, Josep, Garcia-Garcia, Selene, Najarro, Adrian, Aldama, Unai, Palom, Adriana et al.
DOI: 10.3390/v14020215

Respiratory Syncytial Virus Infections in Young Children Presenting to Primary Care in Catalonia During the COVID-19 Pandemic.

PMID: 34922377
Revista: Journal of the Pediatric Infectious Diseases Socie
Año: 2022
Referencia: J Pediatric Infect Dis Soc. 2022 Feb 23;11(2):69-72. doi: 10.1093/jpids/piab121.
Factor de impacto: 3.164
Tipo de publicación: Artículo en revista internacional
Autores: Coma, Ermengol, Vila, Jorgina, Mendez-Boo, Leonardo, Anton, Andres, Mora, Nuria, Fina, Francesc, Fabregas, Mireia, Medina, Manuel et al.
DOI: 10.1093/jpids/piab121

Multicenter clinical evaluation of a novel transcription-mediated amplification assay for SARS-CoV-2 molecular testing.

PMID: 35185236
Revista: ENFERMEDADES INFECCIOSAS Y MICROBIOLOGIA CLINICA
Año: 2022
Referencia: Enferm Infecc Microbiol Clin. 2022 Feb 14. pii: S0213-005X(22)00024-6. doi: 10.1016/j.eimc.2022.01.014.
Factor de impacto: 1.731
Tipo de publicación: Artículo en revista nacional
Autores: Camara, Jordi, Anton, Andres, Fernandez-Huerta, Miguel, Salmeron, Paula, Hernandez-Hermida, Yolanda, Andres, Cristina, Niubo, Jordi, Calatayud, Laura, Angeles Dominguez, M, Pumarola, Tomas et al.
DOI: 10.1016/j.eimc.2022.01.014

Peripheral and lung resident memory T cell responses against SARS-CoV-2.

PMID: 34021148
Revista: Nature Communications
Año: 2021
Referencia: Nat Commun. 2021 May 21;12(1):3010. doi: 10.1038/s41467-021-23333-3.
Factor de impacto: 14.919
Tipo de publicación: Artículo en revista internacional
Autores: Perea, David, Rosado, Joel, Falco, Anna, Kirkegaard, Cristina, Torrella, Ariadna, Planas, Bibiana, Navarro, Jordi, Suanzes, Paula, Alvarez-Sierra, Daniel, Ayora, Alfonso et al.
DOI: 10.1038/s41467-021-23333-3

Role of asymptomatic bacteriuria on early periprosthetic joint infection after hip hemiarthroplasty. BARIFER randomized clinical trial.

PMID: 33864153
Revista: EUROPEAN JOURNAL OF CLINICAL MICROBIOLOGY & INFECTIOUS DISEASES
Año: 2021
Referencia: Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 2021 Nov;40(11):2411-2419. doi: 10.1007/s10096-021-04241-2. Epub 2021 Apr 16.
Factor de impacto: 3.267
Tipo de publicación: Artículo en revista internacional
Autores: Rodriguez-Pardo, Dolors, Del Toro, Maria Dolores, Guio-Carrion, Laura, Escudero-Sanchez, Rosa, Fernandez-Sampedro, Marta, Garcia-Viejo, Miguel Angel, Velasco-Arribas, Maria, Soldevila-Boixader, Laura, Femenias, Magdalena, Iribarren, Jose Antonio et al.
DOI: 10.1007/s10096-021-04241-2

Infectious complications of non-surgical biliary tract manipulation in paediatric patients. Role of antibiotic prophylaxis.

PMID: 33715879
Revista: ENFERMEDADES INFECCIOSAS Y MICROBIOLOGIA CLINICA
Año: 2021
Referencia: Enferm Infecc Microbiol Clin (Engl Ed). 2021 Mar 11. pii: S0213-005X(21)00045-8. doi: 10.1016/j.eimc.2021.01.019.
Factor de impacto: 1.731
Tipo de publicación: Artículo en revista nacional
Autores: Soria-Navarro, Beatriz, Mendoza-Palomar, Natalia, Juamperez-Gomi, Javier, Melendo, Susana, Mercadal-Hally, Maria, Lung, Mayli, Perez, Maria Mercedes, Quintero, Jesus, Soler-Palacin, Pere et al.
DOI: 10.1016/j.eimc.2021.01.019

Evaluation of the performance of Loopamp Trypanosoma cruzi Detection Kit for the diagnosis of Chagas disease in a non-endemic area, Spain.

PMID: 33692137
Revista: JOURNAL OF CLINICAL MICROBIOLOGY
Año: 2021
Referencia: J Clin Microbiol. 2021 Apr 20;59(5). pii: JCM.01860-20. doi: 10.1128/JCM.01860-20. Print 2021 Apr 20.
Factor de impacto: 5.948
Tipo de publicación: Artículo en revista internacional
Autores: Flores-Chavez, Maria D, Abras, Alba, Ballart, Cristina, Ibanez Perez, Ismael, Perez-Gordillo, Pilar, Gallego, Montserrat, Moure, Zaira, Sulleiro Igual, Elena, Nieto, Javier, Garcia Diez, Emilia et al.
DOI: 10.1128/JCM.01860-20

Clinical Outcomes of a Zika Virus Mother-Child Pair Cohort in Spain.

PMID: 32392815
Revista: Pathogens
Año: 2020
Referencia: Pathogens. 2020 May 7;9(5). pii: pathogens9050352. doi: 10.3390/pathogens9050352.
Factor de impacto: 3.018
Tipo de publicación: Artículo en revista internacional
Autores: Soler-Palacin, Pere, Espiau, Maria, Salazar, Ainara, Guarch-Ibanez, Borja, Vazquez, Ana, Navarro-Moron, Juan, Ramos-Amador, Jose-Tomas, Martin-Nalda, Andrea, Duenas, Eva, Blazquez-Gamero, Daniel et al.
DOI: 10.3390/pathogens9050352

Necrotizing fasciitis in haematological patients: a different scenario.

PMID: 32399706
Revista: ANNALS OF HEMATOLOGY
Año: 2020
Referencia: Ann Hematol. 2020 Aug;99(8):1741-1747. doi: 10.1007/s00277-020-04061-y. Epub 2020 May 12.
Factor de impacto: 2.904
Tipo de publicación: Artículo en revista internacional
Autores: Albasanz-Puig, A, Rodriguez-Pardo, D, Pigrau, C, Lung, M, Roldan, E, Corona, P S, Almirante, B, Ruiz-Camps, I et al.
DOI: 10.1007/s00277-020-04061-y

Effect of antiviral treatment in older patients hospitalized with confirmed influenza.

PMID: 32234540
Revista: ANTIVIRAL RESEARCH
Año: 2020
Referencia: Antiviral Res. 2020 Jun;178:104785. doi: 10.1016/j.antiviral.2020.104785. Epub 2020 Mar 29.
Factor de impacto: 4.101
Tipo de publicación: Artículo en revista internacional
Autores: Martin, Vicente, Egurrola, Mikel, Morales Suarez-Varela, Maria, Dominguez, Angela, Mayoral, J M, Diaz-Borrego, J, Morillo, A, Perez-Lozano, M J, Gutierrez, J, Perez-Ruiz, M et al.
DOI: 10.1016/j.antiviral.2020.104785

Hospital-acquired influenza infections detected by a surveillance system over six seasons, from 2010/2011 to 2015/2016.

PMID: 31992207
Revista: BMC INFECTIOUS DISEASES
Año: 2020
Referencia: BMC Infect Dis. 2020 Jan 28;20(1):80. doi: 10.1186/s12879-020-4792-7.
Factor de impacto: 2.688
Tipo de publicación: Artículo en revista internacional
Autores: Barrabeig, I, Godoy, P, Soldevila, N, Rius, C, Jane, M, Martinez, A, Cayla, J A, Dominguez, A, Alseda, M, Alvarez, J et al.
DOI: 10.1186/s12879-020-4792-7

The challenge of the laboratory diagnosis in a confirmed congenital Zika virus syndrome in utero: A case report.

PMID: 31096455
Revista: MEDICINE
Año: 2019
Referencia: Medicine (Baltimore). 2019 May;98(20):e15532. doi: 10.1097/MD.0000000000015532.
Factor de impacto: 1.87
Tipo de publicación: Artículo en revista internacional
Autores: Pumarola, Tomas, Soler-Palacin, Pere, Soriano-Arandes, Antoni, Martinon-Torres, Federico, Alarcon, Ana, Melendo, Susana, Sulleiro, Elena, Frick, Marie Antoinette, Rodo, Carlota, Espasa, Mateu et al.
DOI: 10.1097/MD.0000000000015532

Imported strongyloidiasis: Data from 1245 cases registered in the +REDIVI Spanish Collaborative Network (2009-2017).

PMID: 31095570
Revista: PLoS Neglected Tropical Diseases
Año: 2019
Referencia: PLoS Negl Trop Dis. 2019 May 16;13(5):e0007399. doi: 10.1371/journal.pntd.0007399. eCollection 2019 May.
Factor de impacto: 4.487
Tipo de publicación: Artículo en revista internacional
Autores: Salvador, Fernando, Trevino, Begona, Chamorro-Tojeiro, Sandra, Sanchez-Montalva, Adrian, Herrero-Martinez, Juan Maria, Rodriguez-Guardado, Azucena, Serre-Delcor, Nuria, Torrus, Diego, Goikoetxea, Josune, Zubero, Zurine et al.
DOI: 10.1371/journal.pntd.0007399

Retrospective Study of Cystic Echinococcosis in a Recent Cohort of a Referral Center for Liver Surgery.

PMID: 30242646
Revista: JOURNAL OF GASTROINTESTINAL SURGERY
Año: 2019
Referencia: J Gastrointest Surg. 2019 Jun;23(6):1148-1156. doi: 10.1007/s11605-018-3971-y. Epub 2018 Sep 21.
Factor de impacto: 2.686
Tipo de publicación: Artículo en revista internacional
Autores: Escola-Verge, Laura, Salvador, Fernando, Escudero-Fernandez, Jose Miguel, Sanchez-Montalva, Adrian, Sulleiro, Elena, Rando, Ariadna, Bilbao, Itxarone, Lazaro, Jose Luis, Serres, Xavier, Salvador, Josep et al.
DOI: 10.1007/s11605-018-3971-y

Recombinant CV-A6 strains related to hand-foot-mouth disease and herpangina at primary care centers (Barcelona, Spain).

PMID: 31033351
Revista: Future Microbiology
Año: 2019
Referencia: Future Microbiol. 2019 Apr;14:499-507. doi: 10.2217/fmb-2018-0336. Epub 2019 Apr 29.
Factor de impacto: 2.746
Tipo de publicación: Artículo en revista internacional
Autores: Fuentes, Francisco, Rubio, Susana, Pumarola, Tomas, Anton, Andres, Martin, Maria Carmen, Rodrigo, Carlos, Esperalba, Juliana, Andres, Cristina, Guasch, Eulalia, Pinana, Maria et al.
DOI: 10.2217/fmb-2018-0336

Acute periprosthetic joint infection due to Fusobacterium nucleatum in a non-immunocompromised patient. Failure using a Debridement, Antibiotics + Implant retention approach.

PMID: 29307651
Revista: ANAEROBE
Año: 2018
Referencia: Anaerobe. 2018 Feb;49:116-120. doi: 10.1016/j.anaerobe.2017.12.010. Epub 2018 Jan 5.
Factor de impacto: 2.742
Tipo de publicación: Artículo en revista internacional
Autores: Corona, Pablo S, Lung, Mayli, Pigrau, Carles, Soldado, Francisco, Amat, Carles, Carrera, Luis, Rodriguez-Pardo, Dolors et al.
DOI: 10.1016/j.anaerobe.2017.12.010

Zika virus dynamics in body fluids and risk of sexual transmission in a non-endemic area.

PMID: 29194880
Revista: TROPICAL MEDICINE & INTERNATIONAL HEALTH
Año: 2018
Referencia: Trop Med Int Health. 2018 Jan;23(1):92-100. doi: 10.1111/tmi.13019. Epub 2017 Dec 21.
Factor de impacto: 2.541
Tipo de publicación: Artículo en revista internacional
Autores: Molina, Israel, Almirante, Benito, Pumarola, Tomas, Serre, Nuria, Rando, Ariadna, Sanchez-Montalva, Adrian, Pou, Diana, Sulleiro, Elena, Salvador, Fernando, Bocanegra, Cristina et al.
DOI: 10.1111/tmi.13019

Actualidad

Noticias

En el Día Europeo del Uso Prudente de los Antibióticos destacamos la importancia de utilizar estos medicamentos con responsabilidad y de encontrar soluciones innovadoras para combatir esta problemática.

Se trata de un nuevo método diagnóstico diseñado para ser utilizado en regiones endémicas que combina una aplicación móvil con un microscopio robotizado de bajo coste.

La red europea EUPertStrain celebra su reunión anual, centrada en el estudio de la evolución de Bordetella pertussis, bacteria responsable de esta enfermedad que puede ser muy grave en menores de un año.