Servicios y aplicaciones:

• qPCR en tiempo real:
  • Estudios de perfil transcripcional mediante cuantificación relativa y absoluta.
  • Análisis de número de copias génicas del ADN genómico y viral.
  • Estudios de discriminación alélica (detección de SNP).
  • Ensayos de identificación de patógenos.
  • Ensayos HRM (High Resolution Melting): escaneo génico, genotipado de SNPs.

Nuestros servicios incluyen: apoyo al diseño experimental y selección de sondas, formación para el uso de equipos en autoservicio, interpretación de resultados y análisis de los datos. También ofrecemos servicios integrales, desde la extracción del ARN de partida (en colaboración con el Biobanco del Hospital Universitario Vall d'Hebron), la ejecución experimental y el análisis de los datos (en colaboración con la UEB).

• Cuantificación y control de calidad de los ácidos nucleicos mediante chips microfluídicos (Bioanalyzer®):
  • Control de calidad y cuantificación del ARN (algoritmo RIN).
  • Separación automática, medición y cuantificación de fragmentos de ds-ADN.
• Cuantificación fluorométrica de ácidos nucleicos (Picogreen ® para ADN y Ribogreen ® para ARN): un método extremadamente específico y sensible, especialmente útil cuando:
  • Solo hay unas cuantas células disponibles para la extracción del ácido nucleico.
  • Es necesaria una cuantificación muy preciosa (p. ej., para la construcción de bibliotecas en NGS [secuenciación de nueva generación]).

Para obtener más información sobre las diferentes técnicas de cuantificación de ácido nucleico, haz clic aquí.

• Genotipado de ratones, incluidos:
  • Extracción de ADN a partir de diferentes tipos de muestras (cola, oreja, etc.).
  • PCR: personalizada para cada proyecto individual.
  • Análisis para electroforesis en gel.
• Detección de contaminación del patógeno Corynobacterium bovis a partir de muestras de animales de laboratorio y ambientales
• Secuenciación de ADN por electroforesis capilar. El servicio está disponible para diferentes aplicaciones (p. ej., resecuenciación, análisis de microsatélites, secuenciación de fragmentos difíciles) en diferentes formatos (tubos de ensayo, placas). Se proporcionan cebadores universales sin cargo. La UAT gestiona la secuenciación, que está externalizada a un colaborador externo. Para obtener más información, haz clic aquí.
• Servei d'autenticació de línies cel·lulars humanes: verificació de la identitat de línies cel·lulars humanes i detecció de contaminació creuada a partir de creació de perfils d'STR, d'acord amb les normes ANSI/ATCC. L'anàlisi STR es realitza amb el kit GenePrint 10 System® (Promega). Es pot afegir un marcador de ratolí per comprovar les contaminacions creuades. Servei gestionat per la UAT i externalitzat a un col·laborador extern.

Equipamiento:

• PCR en tiempo real:
  • LightCycler480 (Roche): Bloques de placas de 96 y 384 pocillos.
  • QuantStudio 5 (Applied Biosystems): Bloques de placas de 96 pocillos de 0,2 ml
  • QuantStudio 7 Pro (Applied Biosystems): Bloques de placas de 96 pocillos (0,1 ml), de 384 pocillos y bloque específico por TLDAs (tarjetas microfluídias)
     
• Agilent 2100 Bioanalyzer:
  • Chips de ADN: DNA1000.
  • Chips de ARN: Nanochip, Picochip.
  • Los usuarios pueden traer sus chips para procesarlos en la UAT (p. ej. chips de ADN de alta sensibilidad o de ARN pequeños).