El Vall d’Hebron Instituto de Investigación (VHIR) ha participado en un estudio internacional liderado por el Broad Institute of MIT and Harvard que amplía el Cancer Dependency Map (DepMap), un repositorio de referencia con modelos de investigación en cáncer. El trabajo actual, publicado en la revista Nature, incorpora cerca de 150 modelos de cáncer en tres dimensiones de diez tipos diferentes de tumores.

DepMap es un proyecto internacional cuyo objetivo es crear un mapa de vulnerabilidades del cáncer. Gracias a técnicas genómicas y a pruebas de sensibilidad a fármacos, permite identificar posibles dianas terapéuticas y biomarcadores que ayuden a diseñar tratamientos más precisos contra cada tipo de tumor. Toda esta información se pone a disposición de la comunidad científica a través de un portal público para que pueda utilizarse en otros proyectos de investigación.

Hasta hace poco, DepMap solo contaba con datos de cultivos celulares tradicionales, en los que las células crecen sobre una superficie plana. En este nuevo trabajo, se han añadido datos de modelos tridimensionales, como los organoides, que se crean en el laboratorio a partir de células tumorales de pacientes. Su estructura tridimensional permite reproducir algunas características de forma más similar a la del tumor original.

Entre estos modelos incorporados recientemente, el VHIR ha aportado datos de organoides derivados de pacientes con cáncer de endometrio. “Incorporar esta información al DepMap permite comparar los cultivos 2D y 3D e identificar alteraciones que pueden ser relevantes para la supervivencia de las células tumorales”, explica la Dra. Beatriz Villafranca, que realizó su tesis doctoral en el grupo de Investigación Biomédica en Ginecología del VHIR y participó en la caracterización de los modelos de organoides gracias a una estancia en el Broad Institute of MIT and Harvard financiada por el Instituto de Salud Carlos III (ISCIII) a través de una beca M-AES.

Los resultados muestran que los modelos 3D y los modelos tradicionales aportan información complementaria y que disponer de ambos permite obtener una visión más completa de las características de los distintos tumores. Esta información puede ser especialmente útil para identificar nuevos biomarcadores, que pueden ayudar a predecir la respuesta a determinados tratamientos, y para detectar posibles dianas terapéuticas contra el cáncer.

Con esta ampliación, el DepMap se convierte en un recurso más completo para estudiar las características de las células tumorales y permite a los investigadores e investigadoras seleccionar el modelo más adecuado según la investigación que estén llevando a cabo. “Poner en común datos de modelos de distintos tipos de tumores es muy importante para avanzar hacia una investigación del cáncer más precisa e identificar nuevas opciones de tratamiento para los y las pacientes”, destaca la Dra. Eva Colás, codirectora del grupo de Investigación Biomédica en Ginecología del VHIR.