El Vall d’Hebron Institut de Recerca (VHIR) ha participat en un estudi internacional liderat pel Broad Institute of MIT and Harvard que amplia el Cancer Dependency Map (DepMap), un repositori de referència amb models de recerca en càncer. El treball actual, publicat a la revista Nature, incorpora prop de 150 models de càncer en tres dimensions de deu tipus diferents de tumors.

DepMap és un projecte internacional amb l’objectiu de crear un mapa de vulnerabilitats del càncer. Gràcies a tècniques genòmiques i a proves de sensibilitat a medicaments, permet identificar possibles dianes terapèutiques i biomarcadors que ajudin a dissenyar tractaments més precisos contra cada tipus de tumor. Tota aquesta informació es posa a disposició de la comunitat científica a través d’un portal públic perquè es pugui utilitzar en altres projectes de recerca.

Fins fa poc, DepMap comptava només amb dades de cultius cel·lulars tradicionals, en què les cèl·lules creixen sobre una superfície plana. En aquest nou treball, s’hi han afegit dades de models tridimensionals com els organoides, els quals es creen al laboratori a partir de cèl·lules tumorals de pacients. La seva estructura en tres dimensions permet reproduir algunes característiques de forma més similar al tumor original.

Entre aquests models incorporats recentment, el VHIR ha aportat dades d’organoides derivats de pacients amb càncer d’endometri. “Incorporar aquesta informació al DepMap permet comparar els cultius 2D i 3D i identificar alteracions que poden ser rellevants per a la supervivència de les cèl·lules tumorals”, explica la Dra. Beatriz Villafranca, que va dur a terme la seva tesi doctoral al grup de Recerca Biomèdica en Ginecologia del VHIR i va participar en la caracterització dels models d’organoides gràcies a una estada al Broad Institute of MIT and Harvard finançada pel Instituto de Salud Carlos III (ISCIII) a través d’una beca M-AES.

Els resultats mostren que els models 3D i els models tradicionals aporten informació complementària i que disposar de tots dos permet obtenir una visió més completa de les característiques dels diferents tumors. Aquesta informació pot ser especialment útil per identificar nous biomarcadors, que poden ajudar a predir la resposta a determinats tractaments, i per detectar possibles dianes terapèutiques del càncer.

Amb aquesta ampliació, el DepMap es converteix en un recurs més complet per estudiar les característiques de les cèl·lules tumorals i permet als investigadors i investigadores seleccionar el model més adequat segons la recerca que estiguin duent a terme. “Posar en comú dades de models de diferents tipus de tumors és molt important per avançar cap a una recerca del càncer més precisa i per identificar noves opcions de tractament per als i les pacients”, destaca la Dra. Eva Colás, co-cap del grup de Recerca Biomèdica en Ginecologia del VHIR.