L’estructura científica del Vall d’Hebron Institut de Recerca (VHIR) impulsa un model organitzatiu dissenyat per potenciar la recerca clínica i translacional, la innovació i la transferència del coneixement amb un impacte directe en la salut de les persones.

Aquest model s'articula al voltant de cinc Àrees de Recerca, que constitueixen l'eix estructural de l'institut i agrupen els 63 grups de recerca segons àmbits de coneixement especialitzats. Aquesta organització afavoreix una identificació més clara de l'expertesa científica:

• Reforça les sinergies entre grups.
• Facilita una resposta coordinada als principals reptes en salut.
• Afavoreix l’alineació amb les prioritats clíniques i estratègiques de l'Hospital Universitari Vall d'Hebron.

L'estructura es complementa amb el Hub Recerca Pediàtrica i Perinatal, els COREs i els Programes.

El Hub de Recerca Pediàtrica i Perinatal és un espai que integra la recerca des del període prenatal fins a l'adolescència i promou la continuïtat assistencial fins a l'edat adulta. El seu objectiu és impulsar la generació i la transferència de coneixement per millorar la salut i la qualitat de vida d'infants i adolescents, consolidant el VHIR com a referent en aquest àmbit. 

Els COREs (Collaborative Research Strategic Spaces) són espais de recerca transversals i flexibles que fomenten la col·laboració en àrees científiques prioritàries o emergents. Alineats amb l'estratègia institucional i les missions de la Comissió Europea, impulsen noves oportunitats de recerca d'alt impacte i contribueixen a reforçar la competitivitat científica del VHIR. 

Els Programes promouen la col·laboració interdisciplinària en àmbits transversals d'especial interès, com la recerca amb perspectiva de gènere i diversitat o l'aplicació de la cirurgia robòtica i la simulació.