Corresponden al CEEA, dentro de su ámbito de competencia, las siguientes funciones: 

• Informar sobre la realización de los procedimientos de experimentación, previa evaluación de la idoneidad del procedimiento en relación con los objetivos del estudio, la posibilidad de alcanzar conclusiones válidas con el menor número posible de animales, la consideración de métodos alternativos a la utilización de los animales y la idoneidad de las especies seleccionadas.
• Velar para que los animales no sufran innecesariamente y para que se les proporcione, cuando sea necesario, analgésicos, anestésicos u otros métodos destinados a eliminar al máximo el dolor, el sufrimiento, o la angustia. 
• Controlar que se utilizan métodos eutanásicos humanitarios. 
• Velar para que el personal que participa en los procedimientos esté preparado para llevar a cabo las tareas encomendadas. 
• Revisar procedimientos ya evaluados o suspender cualquier procedimiento ya iniciado que no se ajuste a los requisitos que establece el protocolo.