El Dr. Francisco Guarner, investigador del grup de Patologia i Fisiopatologia Digestiva del Vall d’Hebron Institut de Recerca (VHIR) ha participat en el desenvolupament d’un nou mètode tecnològic que ha permès identificar bacteris del microbioma intestinal humà fins ara no reconeguts per altres mètodes. Dels nous bacteris, 8 poden servir com a marcadors preliminars dels pacients amb colitis ulcerosa. Els resultats d’aquest estudi multicèntric han estat publicats a la revista "http://www.nature.com/nmeth/journal/vaop/ncurrent/full/nmeth.2693.html" Nature Methods. El mètode de referència per conèixer la taxonomia dels bacteris es basa en la seqüenciació d’un sol gen, el 16S rRNA, que com s’ha vist fins ara comporta errors, ja que no detecta determinades espècies no conegudes o poc conegudes. En concret, els investigadors calculen que amb l’antic mètode només s’havia identificat el 57% de la diversitat i el 42% de l’abundància de les espècies en el microbioma intestinal humà.Per desenvolupar el nou mètode, els investigadors han utilitzat 40 gens definits com a “marcadors”, ja que no són mòbils (no es transmeten horitzontalment entre bacteris) i només hi ha una còpia d’ells en el genoma, de manera que poden servir per a identificar les diferents espècies bacterianes contingudes en una mostra. Aquest mètode “proporciona molta més resolució, ja que s’ha aconseguit detectar bacteris que no estaven catalogats, i que en molts casos constitueixen més de la meitat de les espècies presents en una mostra”, afirma el Dr. Guarner.En total s’han analitzat 252 mostres fecals procedents de pacients amb colitis ulcerosa de l’Hospital Universitari Vall d’Hebron, i de diferents bancs de mostres de Dinamarca i dels Estats Units, i s’han identificat 8 nous bacteris que no estan presents o són poc abundants en els pacients amb colitis ulcerosa. Fins ara només s’havien detectat 3 marcadors en aquests pacients, de manera que segons l’investigador del VHIR, aquesta troballa “obre la porta a l’estudi d’aquests nous bacteris per identificar si poden jugar un paper rellevant en la colitis ulcerosa”.