Investigadors de Vall d'Hebron Institut de Recerca han participat en un estudi per avaluar els protocols de processament de mostres fecals humanes utilitzats en estudis metagenòmics amb l'objectiu de detectar els punts febles que poden interferir en els resultats de l'anàlisi del microbioma.En la realització d'aquest estudi internacional, que avui es publica a la revista http://www.nature.com/nbt/journal/vaop/ncurrent/full/nbt.3960.html?foxtrotcallback=true" Nature Biotechnology han participat 21 laboratoris d'11 països, entre ells el laboratori de http://www.vhir.org/portal1/grup-equip.asp?s=recerca&contentid=187018&idrefer=187018 Fisiopatologia i Fisiologia Digestiva del VHIR.Amb la creació del consorci MetaHIT, l'any 2008, els investigadors van començar a sospitar que els diferents mètodes de recolecció, processament i anàlisi podien donar lloc a resultats diferents a partir d'una mateixa mostra. Així doncs, l'any 2012 van posar en marxa el projecte International Human Microbiome Standards per detectar quin són els punts que més poden interferir en els resultats d'un anàlisi del microbioma.Per realizar l'estudi, cadascuna de les mostres fecals va ser tractada en 21 laboratoris fent servir el mateix protocol que utilitzen habitualment. Un cop realitzat tot el procés es van quantificar les diferències en la composició microbiana comunitària i es va veure quines d'aquestes diferències eren atribuïdes al mateix protocol i quines a variacions biològiques."Un cop detectats quins eres els punts febles de cada protocol, van arribar a la conclusió que el procediment d'extracció de l'ADN és el pas que més interfereix en els resultats de l'anàlisi del microbioma", explica la Dra. Chaysavanh Manichanh, responsable de la línia de recerca de Microbiota Intestinal del grup de Fisiologia i Fisiologia Digestiva del Vall d'Hebron Institut de Recerca (VHIR).A partir d'aquests resultats, els investigadors consideren que seria recomanable un mètode d'extracció d'ADN estandarditzat per a mostres fecals humanes, que faciliti la transferència d'informació entre laboratoris, ja que això millorarà la comparabilitat dels estudis de microbioma intestinal humà i facilitarà els metanàlisis.L'estudi de la microbioma al VHIRTenint en compte les recomanacions dels estàndards internacionals del Microbioma Humà, els investigadors del VHIR estan estudiant el paper del microbioma humà en diversos trastorns com la malaltia inflamatòria intestinal, la síndrome de l'intestí irritable i la malaltia hepàtica. Per a aquest propòsit, el grup realitza estudis clínics i preclínics i desenvolupa enfocaments moleculars i bioinformàtics per estudiar la composició i la funció de la comunitat microbiana de l'intestí.