Vés al contingut

Microbiologia

El grup de recerca de Microbiologia de l’Institut de Recerca Vall d’Hebron (VHIR) es centra en l’estudi dels aspectes microbiològics —en investigacions bàsiques, translacionals i clíniques— que podrien millorar els resultats dels pacients amb malalties infeccioses.

Les nostres àrees d’investigació prioritària són:

  • Vigilància microbiològica de malalties infeccioses emergents i re-emergents
    • Malalties per infeccions virals de les vies respiratòries 
    • Microorganismes que produeixen malalties prevenibles per vacunació 
    • Malalties infeccioses de transmissió sexual
  • Resistència antimicrobiana
  • Sèpsia
  • Desenvolupament i validació de dispositius de diagnòstic microbiològic ràpid
  • Salut Internacional
  • Hepatitis 

Col·laborem activament amb altres laboratoris de microbiologia, serveis sanitaris, centres i organitzacions nacionals i internacionals, així com amb les diferents xarxes de recerca de l’Instituto de Salud Carlos III a Espanya.

A més, duem a terme una important activitat en la vigilància de l’evolució genotípica i fenotípica dels microorganismes presents a la comunitat quant a la seva virulència, transmissibilitat, escapament antigènic i resistència antimicrobiana, en col·laboració amb les administracions públiques, tant en l’àmbit nacional com internacional.
 

Equip

Yesilkoy Filiz

Yesilkoy Filiz

Investigador/a sènior
Microbiologia
Llegir més
Yesilkoy Filiz

Yesilkoy Filiz

Investigador/a sènior
Microbiologia
Llegir més

Publicacions

In-Host HEV Quasispecies Evolution Shows the Limits of Mutagenic Antiviral Treatments.

PMID: 38139013
Revista: INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES
Any: 2023
Referència: Int J Mol Sci. 2023 Dec 6;24(24):17185. doi: 10.3390/ijms242417185.
Factor d'impacte:
Tipus de publicació: Article en revista internacional
Autors: Adombi, Caroline Melanie; Buti, Maria; Campos, Carolina; Colomer-Castell, Sergi; Cortese, Maria Francesca; Esteban, Juan Ignacio; Garcia-Cehic, Damir; Gregori, Josep; Ibanez-Lligona, Marta; Quer, Josep et al.
DOI: 10.3390/ijms242417185

Epidemiological and Genetic Characterization of Norovirus Outbreaks That Occurred in Catalonia, Spain, 2017-2019.

PMID: 35336893
Revista: Viruses-Basel
Any: 2022
Referència: Viruses. 2022 Feb 27;14(3). pii: v14030488. doi: 10.3390/v14030488.
Factor d'impacte: 5.048
Tipus de publicació: Article en revista internacional
Autors: Razquin, Efren, Cornejo Sanchez, Thais, Bartolome, Rosa, Torner, Nuria, Izquierdo, Conchita, Soldevila, Nuria, Coronas, Lorena, Dominguez, Angela, Fuentes, Cristina, Pinto, Rosa M et al.
DOI: 10.3390/v14030488

Inspecting the Ribozyme Region of Hepatitis Delta Virus Genotype 1: Conservation and Variability.

PMID: 35215809
Revista: Viruses-Basel
Any: 2022
Referència: Viruses. 2022 Jan 22;14(2). pii: v14020215. doi: 10.3390/v14020215.
Factor d'impacte: 5.048
Tipus de publicació: Article en revista internacional
Autors: Rodriguez-Frias, Francisco, Pacin-Ruiz, Beatriz, Cortese, Maria Francesca, Tabernero, David, Sopena, Sara, Gregori, Josep, Garcia-Garcia, Selene, Najarro, Adrian, Aldama, Unai, Palom, Adriana et al.
DOI: 10.3390/v14020215

Respiratory Syncytial Virus Infections in Young Children Presenting to Primary Care in Catalonia During the COVID-19 Pandemic.

PMID: 34922377
Revista: Journal of the Pediatric Infectious Diseases Socie
Any: 2022
Referència: J Pediatric Infect Dis Soc. 2022 Feb 23;11(2):69-72. doi: 10.1093/jpids/piab121.
Factor d'impacte: 3.164
Tipus de publicació: Article en revista internacional
Autors: Coma, Ermengol, Vila, Jorgina, Mendez-Boo, Leonardo, Anton, Andres, Mora, Nuria, Fina, Francesc, Fabregas, Mireia, Medina, Manuel et al.
DOI: 10.1093/jpids/piab121

Multicenter clinical evaluation of a novel transcription-mediated amplification assay for SARS-CoV-2 molecular testing.

PMID: 35185236
Revista: ENFERMEDADES INFECCIOSAS Y MICROBIOLOGIA CLINICA
Any: 2022
Referència: Enferm Infecc Microbiol Clin. 2022 Feb 14. pii: S0213-005X(22)00024-6. doi: 10.1016/j.eimc.2022.01.014.
Factor d'impacte: 1.731
Tipus de publicació: Article en revista nacional
Autors: Camara, Jordi, Anton, Andres, Fernandez-Huerta, Miguel, Salmeron, Paula, Hernandez-Hermida, Yolanda, Andres, Cristina, Niubo, Jordi, Calatayud, Laura, Angeles Dominguez, M, Pumarola, Tomas et al.
DOI: 10.1016/j.eimc.2022.01.014

Peripheral and lung resident memory T cell responses against SARS-CoV-2.

PMID: 34021148
Revista: Nature Communications
Any: 2021
Referència: Nat Commun. 2021 May 21;12(1):3010. doi: 10.1038/s41467-021-23333-3.
Factor d'impacte: 14.919
Tipus de publicació: Article en revista internacional
Autors: Perea, David, Rosado, Joel, Falco, Anna, Kirkegaard, Cristina, Torrella, Ariadna, Planas, Bibiana, Navarro, Jordi, Suanzes, Paula, Alvarez-Sierra, Daniel, Ayora, Alfonso et al.
DOI: 10.1038/s41467-021-23333-3

Role of asymptomatic bacteriuria on early periprosthetic joint infection after hip hemiarthroplasty. BARIFER randomized clinical trial.

PMID: 33864153
Revista: EUROPEAN JOURNAL OF CLINICAL MICROBIOLOGY & INFECTIOUS DISEASES
Any: 2021
Referència: Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 2021 Nov;40(11):2411-2419. doi: 10.1007/s10096-021-04241-2. Epub 2021 Apr 16.
Factor d'impacte: 3.267
Tipus de publicació: Article en revista internacional
Autors: Rodriguez-Pardo, Dolors, Del Toro, Maria Dolores, Guio-Carrion, Laura, Escudero-Sanchez, Rosa, Fernandez-Sampedro, Marta, Garcia-Viejo, Miguel Angel, Velasco-Arribas, Maria, Soldevila-Boixader, Laura, Femenias, Magdalena, Iribarren, Jose Antonio et al.
DOI: 10.1007/s10096-021-04241-2

Infectious complications of non-surgical biliary tract manipulation in paediatric patients. Role of antibiotic prophylaxis.

PMID: 33715879
Revista: ENFERMEDADES INFECCIOSAS Y MICROBIOLOGIA CLINICA
Any: 2021
Referència: Enferm Infecc Microbiol Clin (Engl Ed). 2021 Mar 11. pii: S0213-005X(21)00045-8. doi: 10.1016/j.eimc.2021.01.019.
Factor d'impacte: 1.731
Tipus de publicació: Article en revista nacional
Autors: Soria-Navarro, Beatriz, Mendoza-Palomar, Natalia, Juamperez-Gomi, Javier, Melendo, Susana, Mercadal-Hally, Maria, Lung, Mayli, Perez, Maria Mercedes, Quintero, Jesus, Soler-Palacin, Pere et al.
DOI: 10.1016/j.eimc.2021.01.019

Evaluation of the performance of Loopamp Trypanosoma cruzi Detection Kit for the diagnosis of Chagas disease in a non-endemic area, Spain.

PMID: 33692137
Revista: JOURNAL OF CLINICAL MICROBIOLOGY
Any: 2021
Referència: J Clin Microbiol. 2021 Apr 20;59(5). pii: JCM.01860-20. doi: 10.1128/JCM.01860-20. Print 2021 Apr 20.
Factor d'impacte: 5.948
Tipus de publicació: Article en revista internacional
Autors: Flores-Chavez, Maria D, Abras, Alba, Ballart, Cristina, Ibanez Perez, Ismael, Perez-Gordillo, Pilar, Gallego, Montserrat, Moure, Zaira, Sulleiro Igual, Elena, Nieto, Javier, Garcia Diez, Emilia et al.
DOI: 10.1128/JCM.01860-20

Clinical Outcomes of a Zika Virus Mother-Child Pair Cohort in Spain.

PMID: 32392815
Revista: Pathogens
Any: 2020
Referència: Pathogens. 2020 May 7;9(5). pii: pathogens9050352. doi: 10.3390/pathogens9050352.
Factor d'impacte: 3.018
Tipus de publicació: Article en revista internacional
Autors: Soler-Palacin, Pere, Espiau, Maria, Salazar, Ainara, Guarch-Ibanez, Borja, Vazquez, Ana, Navarro-Moron, Juan, Ramos-Amador, Jose-Tomas, Martin-Nalda, Andrea, Duenas, Eva, Blazquez-Gamero, Daniel et al.
DOI: 10.3390/pathogens9050352

Necrotizing fasciitis in haematological patients: a different scenario.

PMID: 32399706
Revista: ANNALS OF HEMATOLOGY
Any: 2020
Referència: Ann Hematol. 2020 Aug;99(8):1741-1747. doi: 10.1007/s00277-020-04061-y. Epub 2020 May 12.
Factor d'impacte: 2.904
Tipus de publicació: Article en revista internacional
Autors: Albasanz-Puig, A, Rodriguez-Pardo, D, Pigrau, C, Lung, M, Roldan, E, Corona, P S, Almirante, B, Ruiz-Camps, I et al.
DOI: 10.1007/s00277-020-04061-y

Effect of antiviral treatment in older patients hospitalized with confirmed influenza.

PMID: 32234540
Revista: ANTIVIRAL RESEARCH
Any: 2020
Referència: Antiviral Res. 2020 Jun;178:104785. doi: 10.1016/j.antiviral.2020.104785. Epub 2020 Mar 29.
Factor d'impacte: 4.101
Tipus de publicació: Article en revista internacional
Autors: Martin, Vicente, Egurrola, Mikel, Morales Suarez-Varela, Maria, Dominguez, Angela, Mayoral, J M, Diaz-Borrego, J, Morillo, A, Perez-Lozano, M J, Gutierrez, J, Perez-Ruiz, M et al.
DOI: 10.1016/j.antiviral.2020.104785

Hospital-acquired influenza infections detected by a surveillance system over six seasons, from 2010/2011 to 2015/2016.

PMID: 31992207
Revista: BMC INFECTIOUS DISEASES
Any: 2020
Referència: BMC Infect Dis. 2020 Jan 28;20(1):80. doi: 10.1186/s12879-020-4792-7.
Factor d'impacte: 2.688
Tipus de publicació: Article en revista internacional
Autors: Barrabeig, I, Godoy, P, Soldevila, N, Rius, C, Jane, M, Martinez, A, Cayla, J A, Dominguez, A, Alseda, M, Alvarez, J et al.
DOI: 10.1186/s12879-020-4792-7

The challenge of the laboratory diagnosis in a confirmed congenital Zika virus syndrome in utero: A case report.

PMID: 31096455
Revista: MEDICINE
Any: 2019
Referència: Medicine (Baltimore). 2019 May;98(20):e15532. doi: 10.1097/MD.0000000000015532.
Factor d'impacte: 1.87
Tipus de publicació: Article en revista internacional
Autors: Pumarola, Tomas, Soler-Palacin, Pere, Soriano-Arandes, Antoni, Martinon-Torres, Federico, Alarcon, Ana, Melendo, Susana, Sulleiro, Elena, Frick, Marie Antoinette, Rodo, Carlota, Espasa, Mateu et al.
DOI: 10.1097/MD.0000000000015532

Imported strongyloidiasis: Data from 1245 cases registered in the +REDIVI Spanish Collaborative Network (2009-2017).

PMID: 31095570
Revista: PLoS Neglected Tropical Diseases
Any: 2019
Referència: PLoS Negl Trop Dis. 2019 May 16;13(5):e0007399. doi: 10.1371/journal.pntd.0007399. eCollection 2019 May.
Factor d'impacte: 4.487
Tipus de publicació: Article en revista internacional
Autors: Salvador, Fernando, Trevino, Begona, Chamorro-Tojeiro, Sandra, Sanchez-Montalva, Adrian, Herrero-Martinez, Juan Maria, Rodriguez-Guardado, Azucena, Serre-Delcor, Nuria, Torrus, Diego, Goikoetxea, Josune, Zubero, Zurine et al.
DOI: 10.1371/journal.pntd.0007399

Retrospective Study of Cystic Echinococcosis in a Recent Cohort of a Referral Center for Liver Surgery.

PMID: 30242646
Revista: JOURNAL OF GASTROINTESTINAL SURGERY
Any: 2019
Referència: J Gastrointest Surg. 2019 Jun;23(6):1148-1156. doi: 10.1007/s11605-018-3971-y. Epub 2018 Sep 21.
Factor d'impacte: 2.686
Tipus de publicació: Article en revista internacional
Autors: Escola-Verge, Laura, Salvador, Fernando, Escudero-Fernandez, Jose Miguel, Sanchez-Montalva, Adrian, Sulleiro, Elena, Rando, Ariadna, Bilbao, Itxarone, Lazaro, Jose Luis, Serres, Xavier, Salvador, Josep et al.
DOI: 10.1007/s11605-018-3971-y

Recombinant CV-A6 strains related to hand-foot-mouth disease and herpangina at primary care centers (Barcelona, Spain).

PMID: 31033351
Revista: Future Microbiology
Any: 2019
Referència: Future Microbiol. 2019 Apr;14:499-507. doi: 10.2217/fmb-2018-0336. Epub 2019 Apr 29.
Factor d'impacte: 2.746
Tipus de publicació: Article en revista internacional
Autors: Fuentes, Francisco, Rubio, Susana, Pumarola, Tomas, Anton, Andres, Martin, Maria Carmen, Rodrigo, Carlos, Esperalba, Juliana, Andres, Cristina, Guasch, Eulalia, Pinana, Maria et al.
DOI: 10.2217/fmb-2018-0336

Acute periprosthetic joint infection due to Fusobacterium nucleatum in a non-immunocompromised patient. Failure using a Debridement, Antibiotics + Implant retention approach.

PMID: 29307651
Revista: ANAEROBE
Any: 2018
Referència: Anaerobe. 2018 Feb;49:116-120. doi: 10.1016/j.anaerobe.2017.12.010. Epub 2018 Jan 5.
Factor d'impacte: 2.742
Tipus de publicació: Article en revista internacional
Autors: Corona, Pablo S, Lung, Mayli, Pigrau, Carles, Soldado, Francisco, Amat, Carles, Carrera, Luis, Rodriguez-Pardo, Dolors et al.
DOI: 10.1016/j.anaerobe.2017.12.010

Zika virus dynamics in body fluids and risk of sexual transmission in a non-endemic area.

PMID: 29194880
Revista: TROPICAL MEDICINE & INTERNATIONAL HEALTH
Any: 2018
Referència: Trop Med Int Health. 2018 Jan;23(1):92-100. doi: 10.1111/tmi.13019. Epub 2017 Dec 21.
Factor d'impacte: 2.541
Tipus de publicació: Article en revista internacional
Autors: Molina, Israel, Almirante, Benito, Pumarola, Tomas, Serre, Nuria, Rando, Ariadna, Sanchez-Montalva, Adrian, Pou, Diana, Sulleiro, Elena, Salvador, Fernando, Bocanegra, Cristina et al.
DOI: 10.1111/tmi.13019

Actualitat

Notícies

En el Dia Europeu de l’Ús Prudent dels Antibiòtics destaquem la importància de fer servir aquests medicaments amb responsabilitat i de trobar solucions innovadores per lluitar contra aquesta problemàtica.

Es tracta d'un nou mètode diagnòstic dissenyat per ser utilitzat en regions endèmiques que combina una aplicació mòbil amb un microscopi robotitzat de baix cost.

La xarxa europea EUPertStrain celebra la seva reunió anual, centrada en l’estudi de l’evolució de Bordetella pertussis, bacteri responsable d’aquesta malaltia que pot ser molt greu en menors d’un any.