Josep Quer Sivila

Soc investigador sènior del VHIR, especialitzat en Virologia. Des de 1989 he centrat els estudis en la recerca sobre la infecció pel virus de l'Hepatitis C (VHC) amb èmfasi especial en la diversitat viral, havent participat, el 1992, en la primera descripció de la naturalesa en quasispecies del VHC. Des del 2010, vam centrar la nostra recerca en l'ús de plataformes de seqüenciació de nova generació (NGS) per estudiar la diversitat dels genomes virals, especialment en el context de les hepatitis virals (A, B, C, D i E). Hem aconseguit patentar i traslladar a diagnòstic de rutina un mètode de classificació de subtipus i un altre mètode per reportar les resistències als tractaments antivirals contra el VHC. La seqüenciació completa del SARS-CoV-2 el març de 2020, ha permès fer un seguiment de genomes defectius en les variants que han dominat cada onada de SARS-CoV-2. En l'actualitat estem desenvolupant pipelines bioinformàtics per estudis de metagenòmica.

Institucions de les que formen part

Investigador/a principal
Malalties hepàtiques

Vall Hebron Institut de Recerca

Josep Quer Sivila

Institucions de les que formen part

Investigador/a principal
Malalties hepàtiques

Vall Hebron Institut de Recerca

Senior Researcher at Vall d'Hebron Institut of Research (VHIR), Vall d'Hebron Barcelona Hospital Campus from 2021 (indefinite contract). Associate Professor at the Biochemistry and Molecular Department of the UAB from 2021 to present (3933001435 Y0LOU0146). Accredited researcher at CIBERehd (2010-prest). Accredited as Professor (Catedrático) from AQU (Generalitat de Catalunya) from 2023.
Academic background:
Bachelor in Biology from UB (1981-86).
PhD in Biology from UAB (1994) with extraordinary award.
Postdoctoral stay in the University of California at San Diego USA (1994-96).
Member of Ciberehd since 2007-act.
Associate Professor (AP) of Immunology, UB (1988-89); AP Medicine, UAB (2003-18); AP of Biochemistry and Molecular Biology, UAB (2021-pres.).
General Coordinator Master in "Translational Biomedical Research" VHIR-UAB (2020-pres.). Professor and coordinator of Module 1 Master in "Translational Biomedical Research" VHIR-UAB since 2014-pres.

Scientific and professional activities:
Projects: Since 2016, he has led 10 overlapping competitive financed projects, serving as the Principal Investigator (PI) in eight national projects and as the co-IP of the local-node in two European Union projects.
Thesis: 6 PhD thesis directed, and 3 under development.
Papers and reviews: 154 papers; 8 book chapters & 1 book published in 2023.
Meetings participation: 220, 66 of them as invited speaker.

Other merits:
Member Coordinator Committee “Strategic Plan for Tackling hepatitis C (PEAHC) Spanish Ministry of Health;
Treasurer Spanish Society of Virology (SEV) (2009-pres.);
Member of scientific societies (ESV;AEEH;SCB) and of Alliance for the Elimination of Hepatitis in Spain (AEHVE).
Organizing Committee of International Symposium Fundación Ramón Areces (2013); and SEV National Meetings (2013-2015-2017-2019-2022).

Impacts printed, digital, radio and TV. NGS-2010: 32 impacts; HCV-2015: 69 impacts; SARS-CoV-2 – 2020-23: 90 impacts.

Awards: Ciudad de Barcelona (1996); Best ideas Diario Medico (2015); Premi Ciència i Tecnologia Diari Regió7-Prensa Ibérica (2020).

Metrics: h-index:41 (scholar), 35 (WoS), 37 (Scopus); i10-index: 116; Citations (WoS): 8371; Views: >40000. ORCID: 0000-0003-0014-084X // WOS ResearcherID A-6741-2012 // SCOPUS ID: 7004592398

Social media:
Linkedin: Josep Quer
Twitter (X): @JosepQuerSivila / @VirusLabQ (Virus Lab by Dr. Josep Quer) / @HepatitisSEV

Línies de recerca

Hepatitis virals - biologia molecular

Subtipat i resistències del virus de la hepatitis C

Quasispècies del virus de la hepatitis E

Exosomes hepàtics en malalties hepàtiques i tumors hepàtics

Identificació, caracterització i variabilitat d’agents virals per seqüenciació massiva, Next Generation Sequencing (NGS)

Serveis o tecnologies rellevants

Seqüenciació Sanger i massiva (NGS)

Extracció i amplificació àcids nucleics

Filogènia molecular disseny primers

Tècniques de Biologia Molecular

Gradients per aïllament i estudi d'exosomes en plasma i femta

Citometria de Flux

Resposta immune cel·lular

Cultius

Clonació, expressió de proteïnes recombinants en cultius cel·lulars

Bioinformàtica

IP: Juan Ignacio Esteban Mur, Josep Quer Sivila

Projectes

Application of bioinformatic tools in the diagnosis of infectious diseases through metagenomics and deep-sequencing

IP: Josep Quer Sivila
Col·laboradors: Miriam Izquierdo Sans
Entitat finançadora: Fundació "La Caixa"
Finançament: 117900
Referència: 132074
Durada: 01/09/2023 - 31/08/2026

Beca VHIR PhD

IP: Josep Quer Sivila
Col·laboradors: Sira Rodrigo Bosch, Laia Perez Lasarte, Carolina Campos Martinez
Entitat finançadora: Fundació Institut de Recerca HUVH
Finançament: 69188.74
Referència: VPHD/CAROLINA_C
Durada: 01/04/2023 - 31/03/2026

Estudio de quasispecies por metagenómica en neuropatías asociadas a virus por secuenciación masiva de nueva generación.

IP: Josep Quer Sivila
Col·laboradors: Sergi Colomer Castell, Lluís Viladomiu Catà, Damir Garcia Cehic, Maria Piñana Moro, Pablo Gabriel Medina, Arnau Llauradó Gayete, Carolina Campos Martinez, Alejandra Gonzalez Sánchez
Entitat finançadora: Instituto de Salud Carlos III
Finançament: 292820
Referència: PI22/00258
Durada: 01/01/2023 - 31/12/2025

FPU 2021

IP: Josep Quer Sivila
Col·laboradors: Sergi Colomer Castell
Entitat finançadora: Ministerio de Universidades
Finançament: 73389.26
Referència: FPU21/04150
Durada: 16/12/2022 - 15/05/2025