Vés al contingut

Microbiologia

El grup de recerca de Microbiologia de l’Institut de Recerca Vall d’Hebron (VHIR) es centra en l’estudi dels aspectes microbiològics —en investigacions bàsiques, translacionals i clíniques— que podrien millorar els resultats dels pacients amb malalties infeccioses.

Les nostres àrees d’investigació prioritària són:

  • Vigilància microbiològica de malalties infeccioses emergents i re-emergents
    • Malalties per infeccions virals de les vies respiratòries 
    • Microorganismes que produeixen malalties prevenibles per vacunació 
    • Malalties infeccioses de transmissió sexual
  • Resistència antimicrobiana
  • Sèpsia
  • Desenvolupament i validació de dispositius de diagnòstic microbiològic ràpid
  • Salut Internacional
  • Hepatitis 

Col·laborem activament amb altres laboratoris de microbiologia, serveis sanitaris, centres i organitzacions nacionals i internacionals, així com amb les diferents xarxes de recerca de l’Instituto de Salud Carlos III a Espanya.

A més, duem a terme una important activitat en la vigilància de l’evolució genotípica i fenotípica dels microorganismes presents a la comunitat quant a la seva virulència, transmissibilitat, escapament antigènic i resistència antimicrobiana, en col·laboració amb les administracions públiques, tant en l’àmbit nacional com internacional.
 

Equip

Virginia Rodríguez Garrido

Virginia Rodríguez Garrido

Investigador/a predoctoral
Microbiologia
Llegir més
Yannick Hoyos Mallecot

Yannick Hoyos Mallecot

Investigador/a postdoctoral
Microbiologia
Llegir més
Yesilkoy Filiz

Yesilkoy Filiz

Investigador/a sènior
Microbiologia
Llegir més
Virginia Rodríguez Garrido

Virginia Rodríguez Garrido

Investigador/a predoctoral
Microbiologia
Llegir més
Yannick Hoyos Mallecot

Yannick Hoyos Mallecot

Investigador/a postdoctoral
Microbiologia
Llegir més
Yesilkoy Filiz

Yesilkoy Filiz

Investigador/a sènior
Microbiologia
Llegir més

Publicacions

Pralsetinib in Patients with Advanced/metastatic RET-altered Thyroid Cancer: Updated Efficacy and Safety Data from the ARROW Study.

PMID: 38009200
Revista: THYROID
Any: 2023
Referència: Thyroid. 2023 Nov 27. doi: 10.1089/thy.2023.0363.
Factor d'impacte:
Tipus de publicació: Article en revista internacional
Autors: Adkins, Douglas R; Ahn, Myung-Ju; Alonso, Guzman; Barata, Teresa; Bordogna, Walter; Brose, Marcia; Cassier, Philippe A; Chul Cho, Byoung; Curigliano, Giuseppe; Gainor, Justin F et al.
DOI: 10.1089/thy.2023.0363

Standardising personalised diabetes care across European health settings: A person-centred outcome set agreed in a multinational Delphi study.

PMID: 38017616
Revista: DIABETIC MEDICINE
Any: 2023
Referència: Diabet Med. 2023 Nov 28:e15259. doi: 10.1111/dme.15259.
Factor d'impacte:
Tipus de publicació: Article en revista internacional
Autors: Aanstoot, Henk-Jan; Aguilera, Antonio; Benard, Angele Helene Marie; Benito, Rafael; de-Mendoza, Carmen; Del Pozo, Carmen Hurtado; Delbecque, Laure; Due-Christensen, Mette; Eeg-Olofsson, Katarina; Eiros, Jose Maria et al.
DOI: 10.1111/dme.15259

iMAGING: a novel automated system for malaria diagnosis by using artificial intelligence tools and a universal low-cost robotized microscope.

PMID: 38075929
Revista: Frontiers in Microbiology
Any: 2023
Referència: Front Microbiol. 2023 Nov 24;14:1240936. doi: 10.3389/fmicb.2023.1240936. eCollection 2023.
Factor d'impacte:
Tipus de publicació: Article en revista internacional
Autors: Abello, Alberto; Bilalli, Besim; Clols, Elisa Sayrol; de Oliveira, Allisson Dantas; Espasa, Mateu; Joseph-Munne, Joan; Lopez-Codina, Daniel; Maturana, Carles Rubio; Nadal, Sergi; Ruiz, Edurne et al.
DOI: 10.3389/fmicb.2023.1240936

Etiology and antimicrobial resistance patterns in chronic osteomyelitis of the tibia: an 11-year clinical experience.

PMID: 38133804
Revista: ARCHIVES OF ORTHOPAEDIC AND TRAUMA SURGERY
Any: 2023
Referència: Arch Orthop Trauma Surg. 2023 Dec 22. doi: 10.1007/s00402-023-05095-3.
Factor d'impacte:
Tipus de publicació: Article en revista internacional
Autors: Carbonell-Rosell, Carla; Corona, Pablo S; Lakhani, Kushal; Lung, Mayli; Nadal, Patricia; Rodriguez-Pardo, Dolors et al.
DOI: 10.1007/s00402-023-05095-3

Standardized Hepatitis B Virus RNA Quantification in Untreated and Treated Chronic Patients: a Promising Marker of Infection Follow-Up.

PMID: 35377229
Revista: Microbiology Spectrum
Any: 2022
Referència: Microbiol Spectr. 2022 Apr 27;10(2):e0214921. doi: 10.1128/spectrum.02149-21. Epub 2022 Apr 4.
Factor d'impacte: 7.171
Tipus de publicació: Article en revista internacional
Autors: Rodriguez-Frias, Francisco, Buti, Maria, Pumarola, Tomas, Garcia-Garcia, Selene, Cortese, Maria Francesca, Riveiro-Barciela, Mar, Tabernero, David, Rodriguez-Algarra, Francisco, Palom, Adriana, Sopena, Sara et al.
DOI: 10.1128/spectrum.02149-21

Positive Polymerase Chain Reaction for SARS-CoV-2 in a Candidate Does Not Always Preclude Liver Transplantation: Case Report and Literature Review.

PMID: 35352636
Revista: Experimental and Clinical Transplantation
Any: 2022
Referència: Exp Clin Transplant. 2022 Mar;20(3):321-324. doi: 10.6002/ect.2021.0387.
Factor d'impacte: 0.945
Tipus de publicació: Carta o abstract
Autors: Len, Oscar, Castells, Lluis, Nuvials, Xavier, Sellares-Nadal, Julia, Esperalba, Juliana, Marquez-Algaba, Ester, Los-Arcos, Ibai, Anton, Andres et al.
DOI: 10.6002/ect.2021.0387

COVID-19: an opportunity of systematic integration for Chagas disease. Example of a community-based approach within the Bolivian population in Barcelona.

PMID: 35346096
Revista: BMC INFECTIOUS DISEASES
Any: 2022
Referència: BMC Infect Dis. 2022 Mar 28;22(1):298. doi: 10.1186/s12879-022-07305-6.
Factor d'impacte: 3.09
Tipus de publicació: Article en revista internacional
Autors: Gomez I Prat, Jordi, Essadek, Hakima Ouaarab, Esperalba, Juliana, Serrat, Francesc Zarzuela, Guiu, Isabel Claveria, Goterris, Lidia, Zules-Ona, Ricardo, Choque, Estefa, Pastoret, Conxita, Ponces, Natalia Casamitjana et al.
DOI: 10.1186/s12879-022-07305-6

Epidemiological and Genetic Characterization of Norovirus Outbreaks That Occurred in Catalonia, Spain, 2017-2019.

PMID: 35336893
Revista: Viruses-Basel
Any: 2022
Referència: Viruses. 2022 Feb 27;14(3). pii: v14030488. doi: 10.3390/v14030488.
Factor d'impacte: 5.048
Tipus de publicació: Article en revista internacional
Autors: Razquin, Efren, Cornejo Sanchez, Thais, Bartolome, Rosa, Torner, Nuria, Izquierdo, Conchita, Soldevila, Nuria, Coronas, Lorena, Dominguez, Angela, Fuentes, Cristina, Pinto, Rosa M et al.
DOI: 10.3390/v14030488

Enterovirus-A71 Rhombencephalitis Outbreak in Catalonia: Characteristics, Management and Outcome.

PMID: 34097655
Revista: PEDIATRIC INFECTIOUS DISEASE JOURNAL
Any: 2021
Referència: Pediatr Infect Dis J. 2021 Jul 1;40(7):628-633. doi: 10.1097/INF.0000000000003114.
Factor d'impacte: 2.129
Tipus de publicació: Article en revista internacional
Autors: Anton, Andres, Castellarnau, Ester, Delgado, Ignacio, Vazquez, Elida, Gonzalez, Sebastia, Mayol, Lluis, Mendez, Maria, Sole, Eduard, Rosal, Jaume, Andres, Cristina et al.
DOI: 10.1097/INF.0000000000003114

Intra-Discrete Typing Unit TcV Genetic Variability of Trypanosoma cruzi in Chronic Chagas' Disease Bolivian Immigrant Patients in Barcelona, Spain.

PMID: 34095255
Revista: Frontiers in Cardiovascular Medicine
Any: 2021
Referència: Front Cardiovasc Med. 2021 May 20;8:665624. doi: 10.3389/fcvm.2021.665624. eCollection 2021.
Factor d'impacte: 6.05
Tipus de publicació: Article en revista internacional
Autors: de Oliveira, Maykon Tavares, Sulleiro, Elena, da Silva, Maria Claudia, Silgado, Aroa, de Lana, Marta, da Silva, Joao Santana, Molina, Israel, Marin-Neto, J Antonio et al.
DOI: 10.3389/fcvm.2021.665624

Risk of SARS-CoV-2 Infection in Previously Infected and Non-Infected Cohorts of Health Workers at High Risk of Exposure.

PMID: 34064314
Revista: Journal of Clinical Medicine
Any: 2021
Referència: J Clin Med. 2021 May 4;10(9). pii: jcm10091968. doi: 10.3390/jcm10091968.
Factor d'impacte: 4.242
Tipus de publicació: Article en revista internacional
Autors: Sanchez-Montalva, Adrian, Fernandez-Naval, Candela, Anton, Andres, Dura, Xavier, Vimes, Alba, Silgado, Aroa, Velasquez-Orozco, Fernando, Espinosa-Pereiro, Juan, Salvador, Fernando, Pumarola, Tomas et al.
DOI: 10.3390/jcm10091968

Nasal high flow oxygen therapy in COVID-19 patients does not cause environmental surface contamination.

PMID: 34082060
Revista: JOURNAL OF HOSPITAL INFECTION
Any: 2021
Referència: J Hosp Infect. 2021 Oct;116:103-105. doi: 10.1016/j.jhin.2021.04.034. Epub 2021 May 31.
Factor d'impacte: 3.926
Tipus de publicació: Carta o abstract
Autors: Armadans, Lluis, Segales, Joaquim, Pumarola, Tomas, Campins, Magda, Ferrer, Ricard, Rodriguez-Garrido, Virginia, Vergara-Alert, Julia, Anton, Andres, Rodon, Jordi, Pacheco, Andres et al.
DOI: 10.1016/j.jhin.2021.04.034

Conservation and variability of hepatitis B core at different chronic hepatitis stages.

PMID: 32523313
Revista: WORLD JOURNAL OF GASTROENTEROLOGY
Any: 2020
Referència: World J Gastroenterol. 2020 May 28;26(20):2584-2598. doi: 10.3748/wjg.v26.i20.2584.
Factor d'impacte: 3.665
Tipus de publicació: Article en revista internacional
Autors: Rodriguez-Frias, Francisco, Buti, Maria, Esteban, Rafael, Yll, Marcal, Cortese, Maria Francesca, Guerrero-Murillo, Mercedes, Orriols, Gerard, Gregori, Josep, Casillas, Rosario, Gonzalez, Carolina et al.
DOI: 10.3748/wjg.v26.i20.2584

Quantification of parasite burden of Trypanosoma cruzi and identification of Discrete Typing Units (DTUs) in blood samples of Latin American immigrants residing in Barcelona, Spain.

PMID: 32497037
Revista: PLoS Neglected Tropical Diseases
Any: 2020
Referència: PLoS Negl Trop Dis. 2020 Jun 4;14(6):e0008311. doi: 10.1371/journal.pntd.0008311. eCollection 2020 Jun.
Factor d'impacte: 3.885
Tipus de publicació: Article en revista internacional
Autors: Tavares de Oliveira, Maykon, Sulleiro, Elena, Silgado Gimenez, Aroa, de Lana, Marta, Zingales, Bianca, Santana da Silva, Joao, Marin-Neto, J Antonio, Molina, Israel et al.
DOI: 10.1371/journal.pntd.0008311

Clinical evaluation of the ResistancePlus MG FleXible test on the GeneXpert Infinity-48s instrument: a near-patient assay for simultaneous detection of Mycoplasma genitalium and macrolide resistance.

PMID: 32451118
Revista: DIAGNOSTIC MICROBIOLOGY AND INFECTIOUS DISEASE
Any: 2020
Referència: Diagn Microbiol Infect Dis. 2020 Aug;97(4):115062. doi: 10.1016/j.diagmicrobio.2020.115062. Epub 2020 Apr 17.
Factor d'impacte: 2.499
Tipus de publicació: Article en revista internacional
Autors: Tulsiani-Drud, Suhella, Barbera, Maria-Jesus, Hoyos-Mallecot, Yannick, Serra-Pladevall, Judit, Pumarola, Tomas, Espasa, Mateu, Silgado, Aroa, Salmeron, Paula, Fernandez-Huerta, Miguel et al.
DOI: 10.1016/j.diagmicrobio.2020.115062

Leishmania infantum asymptomatic infection in inflammatory bowel disease patients under anti-TNF therapy.

PMID: 32420499
Revista: Heliyon
Any: 2020
Referència: Heliyon. 2020 May 8;6(5):e03940. doi: 10.1016/j.heliyon.2020.e03940. eCollection 2020 May.
Factor d'impacte: 0
Tipus de publicació: Article en revista internacional
Autors: Guillen, M Carmen, Alcover, M Magdalena, Borruel, Natalia, Sulleiro, Elena, Salvador, Fernando, Berenguer, Diana, Herrera-de Guise, Claudia, Rodriguez, Veronica, Moure, Zaira, Sanchez-Montalva, Adrian et al.
DOI: 10.1016/j.heliyon.2020.e03940

Invasive pneumococcal disease and influenza activity in pediatric population. Impact of PCV13 vaccination in pandemic and non-pandemic influenza periods.

PMID: 31189583
Revista: JOURNAL OF CLINICAL MICROBIOLOGY
Any: 2019
Referència: J Clin Microbiol. 2019 Jul 26;57(8). pii: JCM.00363-19. doi: 10.1128/JCM.00363-19. Print 2019 Aug.
Factor d'impacte: 4.959
Tipus de publicació: Article en revista internacional
Autors: Munoz-Almagro, Carmen, Ciruela, Pilar, Soldevila, Nuria, Izquierdo, Conchita, Codina, Maria Gemma, Diaz, Alvaro, Moraga-Llop, Fernando, Garcia-Garcia, Juan Jose, Dominguez, Angela, Hernandez, Sergi et al.
DOI: 10.1128/JCM.00363-19

Chronic Pulmonary Aspergillosis in a Tertiary Care Center in Spain: A Retrospective, Observational Study.

PMID: 31162731
Revista: MYCOSES
Any: 2019
Referència: Mycoses. 2019 Sep;62(9):765-772. doi: 10.1111/myc.12950. Epub 2019 Jun 25.
Factor d'impacte: 3.065
Tipus de publicació: Article en revista internacional
Autors: Ruiz-Camps, Isabel, Roldan, Elisa, Sampol, Julia, Martinez-Marti, Alex, Goterris-Bonet, Lidia, Martin, Maria Teresa, Aguilar-Company, Juan, Almirante, Benito et al.
DOI: 10.1111/myc.12950

Impact of antibiotic resistance on outcomes of neutropenic cancer patients with Pseudomonas aeruginosa bacteraemia (IRONIC study): study protocol of a retrospective multicentre international study.

PMID: 31129580
Revista: BMJ Open
Any: 2019
Referència: BMJ Open. 2019 May 24;9(5):e025744. doi: 10.1136/bmjopen-2018-025744.
Factor d'impacte: 2.376
Tipus de publicació: Article en revista internacional
Autors: Bassetti, Matteo, Albasanz-Puig, Adaia, Gudiol, Carlota, Parody, Rocio, Tebe, Cristian, Akova, Murat, Araos, Rafael, Bote, Anna, Brunel, Anne-Sophie, Calik, Sebnem et al.
DOI: 10.1136/bmjopen-2018-025744

A retrospective study on the influence of siblings' relatedness in Bolivian patients with chronic Chagas disease.

PMID: 31126327
Revista: Parasites & Vectors
Any: 2019
Referència: Parasit Vectors. 2019 May 24;12(1):260. doi: 10.1186/s13071-019-3518-4.
Factor d'impacte: 3.031
Tipus de publicació: Article en revista internacional
Autors: Espinosa-Pereiro, Juan, Sanchez-Montalva, Adrian, Salvador, Fernando, Sao-Aviles, Augusto, Sulleiro, Elena, Molina, Israel et al.
DOI: 10.1186/s13071-019-3518-4

Preservation of Neisseria gonorrhoeae: should swabs be refrigerated or not?: Neisseria gonorrhoeae preservation.

PMID: 29292202
Revista: JOURNAL OF MICROBIOLOGICAL METHODS
Any: 2018
Referència: J Microbiol Methods. 2018 Feb;145:37-39. doi: 10.1016/j.mimet.2017.12.012. Epub 2017 Dec 29.
Factor d'impacte: 1.701
Tipus de publicació: Article en revista internacional
Autors: Serra-Pladevall, Judit, Gulin Blanco, Carlos, Vila Olmo, Neus, Arjona Camacho, Pilar, Andreu Domingo, Antonia et al.
DOI: 10.1016/j.mimet.2017.12.012

Prevalence of Chagas Disease among Solid Organ-Transplanted Patients in a Nonendemic Country.

PMID: 29405102
Revista: AMERICAN JOURNAL OF TROPICAL MEDICINE AND HYGIENE
Any: 2018
Referència: Am J Trop Med Hyg. 2018 Mar;98(3):742-746. doi: 10.4269/ajtmh.17-0735. Epub 2018 Feb 1.
Factor d'impacte: 2.564
Tipus de publicació: Article en revista internacional
Autors: Salvador, Fernando, Sanchez-Montalva, Adrian, Sulleiro, Elena, Moreso, Francesc, Berastegui, Cristina, Caralt, Mireia, Pinazo, Maria-Jesus, Moure, Zaira, Los-Arcos, Ibai, Len, Oscar et al.
DOI: 10.4269/ajtmh.17-0735

Prevalence and molecular characterization of Strongyloides stercoralis, Giardia duodenalis, Cryptosporidium spp., and Blastocystis spp. isolates in school children in Cubal, Western Angola.

PMID: 29378626
Revista: Parasites & Vectors
Any: 2018
Referència: Parasit Vectors. 2018 Jan 29;11(1):67. doi: 10.1186/s13071-018-2640-z.
Factor d'impacte: 3.163
Tipus de publicació: Article en revista internacional
Autors: Aznar-Ruiz-de-Alegria, Maria L, Espasa, Mateu, Ninda, Arlette, Gandasegui, Javier, Sulleiro, Elena, Moreno, Milagros, Salvador, Fernando, Molina, Israel, Rodriguez, Esperanza, Carmena, David et al.
DOI: 10.1186/s13071-018-2640-z

Health Status of Asylum Seekers, Spain.

PMID: 29165223
Revista: AMERICAN JOURNAL OF TROPICAL MEDICINE AND HYGIENE
Any: 2018
Referència: Am J Trop Med Hyg. 2018 Jan;98(1):300-307. doi: 10.4269/ajtmh.17-0438. Epub 2018 Jan 1.
Factor d'impacte: 2.564
Tipus de publicació: Article en revista internacional
Autors: Romero, Israel Molina, Serre-Delcor, Nuria, Ascaso, Carlos, Soriano-Arandes, Antoni, Sanchez, Francisco Collazos, Maruri, Begona Trevino, Sulleiro, Elena, Ciruelo, Diana Pou, Garcia, Cristina Bocanegra et al.
DOI: 10.4269/ajtmh.17-0438

Differences in Neisseria gonorrhoeae population structure and antimicrobial resistance pattern between men who have sex with men and heterosexuals.

PMID: 27758727
Revista: EPIDEMIOLOGY AND INFECTION
Any: 2017
Referència: Epidemiol Infect. 2017 Jan;145(2):379-385. Epub 2016 Oct 19.
Factor d'impacte: 2.075
Tipus de publicació: Article en revista internacional
Autors: Bartolome-Comas, R, Andreu, A, Callarisa, A E, Barbera, M J, Serra-Pladevall, J et al.
DOI: 10.1017/S095026881600234X

Centrality in the host-pathogen interactome is associated with pathogen fitness during infection.

PMID: 28090086
Revista: Nature Communications
Any: 2017
Referència: Nat Commun. 2017 Jan 16;8:14092. doi: 10.1038/ncomms14092.
Factor d'impacte: 12.124
Tipus de publicació: Article en revista internacional
Autors: Crua Asensio, Nuria, Munoz Giner, Elisabet, de Groot, Natalia Sanchez, Torrent Burgas, Marc et al.
DOI: 10.1038/ncomms14092

Infections in intensive care unit adult patients harboring multidrug-resistant Pseudomonas aeruginosa: implications for prevention and therapy.

PMID: 28093651
Revista: EUROPEAN JOURNAL OF CLINICAL MICROBIOLOGY & INFECTIOUS DISEASES
Any: 2017
Referència: Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 2017 Jul;36(7):1097-1104. doi: 10.1007/s10096-016-2894-3. Epub 2017 Jan 16.
Factor d'impacte: 2.727
Tipus de publicació: Article en revista internacional
Autors: Borgatta, B, Lagunes, L, Imbiscuso, A T, Larrosa, M N, Lujan, M, Rello, J et al.
DOI: 10.1007/s10096-016-2894-3

Sentinel surveillance of imported dengue via travellers to Europe 2012 to 2014: TropNet data from the DengueTools Research Initiative.

PMID: 28080959
Revista: Eurosurveillance
Any: 2017
Referència: Euro Surveill. 2017 Jan 5;22(1). pii: 30433. doi: 10.2807/1560-7917.ES.2017.22.1.30433.
Factor d'impacte: 7.202
Tipus de publicació: Article en revista internacional
Autors: Castelli, Francesco, Van Esbroeck, Marjan, Matteelli, Alberto, Rochat, Laurence, Sulleiro, Elena, Kurth, Florian, Gobbi, Federico, Norman, Francesca, Torta, Ilaria, Clerinx, Jan et al.
DOI: 10.2807/1560-7917.ES.2017.22.1.30433

Evaluation of the usefulness of a quantitative blood culture in the diagnosis of catheter-related bloodstream infection: Comparative analysis of two periods (2002 and 2012).

PMID: 26778796
Revista: ENFERMEDADES INFECCIOSAS Y MICROBIOLOGIA CLINICA
Any: 2016
Referència: Enferm Infecc Microbiol Clin. 2016 Oct;34(8):484-9. doi: 10.1016/j.eimc.2015.11.007. Epub 2016 Jan 9.
Factor d'impacte: 1.53
Tipus de publicació: Article en revista internacional
Autors: Planes, Anna Maria, Calleja, Raquel, Bernet, Albert, Campins-Marti, Magda, Almirante, Benito, Pumarola, Tomas, Fernandez-Hidalgo, Nuria et al.
DOI: 10.1016/j.eimc.2015.11.007

Actualitat

Notícies

Es tracta d'un nou mètode diagnòstic dissenyat per ser utilitzat en regions endèmiques que combina una aplicació mòbil amb un microscopi robotitzat de baix cost.

La xarxa europea EUPertStrain celebra la seva reunió anual, centrada en l’estudi de l’evolució de Bordetella pertussis, bacteri responsable d’aquesta malaltia que pot ser molt greu en menors d’un any.

El treball de Vall d’Hebron ha demostrat que les persones vacunades amb Pfizer o Moderna tenen limfòcits T de memòria específics contra el SARS-CoV-2 al pulmó mesos després de la vacunació.

Ofertes de treball

Graduated technician - Infectious Disease research group (L)
Data d'inici:
04/08/2022
Data de fi:
03/10/2022
Document: Descarrega
Senior Researcher in Microbiology
Data d'inici:
13/07/2022
Data de fi:
27/07/2022
Document: Descarrega
Postdoctoral Researcher Microbiology Department
Data d'inici:
30/06/2022
Data de fi:
14/07/2022
Document: Descarrega